Hubo un gran número de musulmanes en esas áreas antes de las Guerras de los Balcanes de finales del siglo XIX.
En 1876, algunas personas estiman que había 1.120.000 musulmanes en Bulgaria (ver Turcos búlgaros). Las fuerzas rusas y los búlgaros expulsaron a la mayoría de ellos del país. Representantes franceses, ingleses, italianos y turcos lo describieron en la Comisión Rhode.
Las poblaciones musulmanas de Bulgaria y Rumania huyeron principalmente a Turquía cuando el Imperio Otomano fue expulsado de los Balcanes por Rusia. Todavía hay cientos de miles de turcos búlgaros, pero son una minoría.
Después de la Primera Guerra Mundial, Grecia y Turquía eliminaron a las minorías musulmana y cristiana en sus respectivos países, y las enviaron al otro país en el intercambio de población entre Grecia y Turquía. 1.300.000 griegos de Anatolia fueron enviados a Grecia desde Turquía, y 500.000 musulmanes griegos fueron enviados a Turquía desde Grecia.
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Bosnia y Albania escaparon de todo esto. Ninguno de ellos fue tomado por el Imperio ruso. En 1832 ocurrió el levantamiento bosnio (1831–32), donde los musulmanes bosnios se rebelaron sin éxito del Imperio Otomano. Con toda probabilidad, cuando el Imperio Austrohúngaro finalmente tomó Bosnia, no expulsaron a los musulmanes bosnios no solo porque eran una gran mayoría, sino porque los veían como un aliado potencial.
Albania también se separó independientemente del Imperio Otomano a pesar de ser musulmán. Sin embargo, durante la Albania comunista, el Islam y el cristianismo fueron fuertemente perseguidos.
Editar:
Aquí hay un mapa que obtuve de McCarthy (2010)
McCarthy, J. y Map, AA (2010). Migración forzada y mortalidad en el imperio otomano. Washington DC: Coalición Turca de América , 2 , 1821-1922.