Al igual que Corea, Japón se habría convertido en un estado vasallo de la dinastía Yuan durante unos 80 años, hasta la caída del dominio mongol en China, o posiblemente antes, cuando el gobierno de la dinastía Yuan comenzó a desmoronarse en las periferias. De cualquier manera, cualquier control que los mongoles hubieran tenido sería, en el mejor de los casos, tenue. Los recursos de los yuanes ya estaban agotados hasta el límite, como lo demuestra su incapacidad para derrotar a los vietnamitas no mucho después.
La regla del clan Hojo fallaría, reemplazada anteriormente por algún otro clan, tal vez los propios shoguns de Minamoto, lo que llevaría a un ascenso Ashikaga un poco más temprano.
El samurai se vería obligado a luchar en los ejércitos mongoles; la próxima gran guerra fue en Vietnam, y podrían ver alguna acción allí, aunque probablemente no lo suficiente como para cambiar el resultado.
Habría dos golpes importantes para la psique y la moral japonesas: la creencia de que Japón no podría ser derrotado y, posiblemente (dependiendo de las condiciones de rendición), una ruptura en la línea imperial. Por otro lado, un levantamiento inevitable y exitoso al final del gobierno de Yuan podría curar a Japón y acercar a los clanes samurai.
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Estirando un poco las cosas, unos siglos después, el espíritu de Kamikaze sería inexistente, y los generales japoneses podrían ser más cautelosos con sus decisiones, lo que llevaría a acciones más racionales durante la Segunda Guerra Mundial.