Heilongjiang y Jilin fueron regiones que cayeron bajo el control de las diversas tribus manchúes. Después de la caída de la dinastía Yuan, hubo varios equipos mongoles en las partes del noreste de la China actual que intentaron restablecer el gobierno de Yuan, y para eliminar la amenaza de ellos, la dinastía Ming, los sucesores del Yuan, estableció relaciones con los Jurchen para contrarrestar cualquier influencia de los leales de Yuan.
Poco a poco, con el tiempo, los jurchens se organizaron en federaciones formadas por varias tribus. A finales de 1500, había dos federaciones de este tipo, Jianzhou y Haixi. Las tribus de Jianzhou vivían en la parte más meridional del noreste y, a medida que la regla Ming se debilitaba, los Jurchens de Jianzhou comenzaron a afirmar su poder, que a costa de la era Ming, aunque oficialmente todavía estaban bajo la soberanía Ming. En 1616, Nurhaci, el jefe de los Jurchens de Jianzhou que para entonces había unido a la mayoría de las diversas tribus Jurchen en una sola unidad y las organizó bajo el sistema de estandarte manchú, estableció la dinastía Jin. El Jin era una antigua dinastía Jurchen que gobernaba las partes del norte de China antes de que los mongoles establecieran su dinastía Yuan. Nurhaci reclamó una continuación del Jin a través de su gobierno.
Los Jurchens ahora unificados, que evolucionaron hacia el pueblo manchú y su “dinastía Jin” (que pasó a llamarse Qing por el hijo de Nurhaci, Hong Taiji) comenzaron a conquistar China y en 1644 derrotaron a las fuerzas de Li Zecheng y capturaron Beijing, estableciendo así la regla Qing en China.
El establecimiento de la regla Qing en China trajo oficialmente a Heilongjiang, Jilin y Liaoning a China “propiamente dicho”. Nurhaci había comenzado a extender primero el dominio Qing (que llamó como Jin) sobre el pueblo Jurchen, y luego sus sucesores continuaron la conquista de China, y así es como las partes del noreste de China se produjeron bajo un gobierno formal.
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Y al igual que el Tíbet, Heilongjiang y Jilin fueron intermitentemente independientes o fueron vasallos de varias dinastías chinas. Pero a veces las regiones eran independientes de facto, a pesar de que se suponía que eran vasallos de China, como en el período de tiempo de Nurhaci.