Al menos el descenso mongol parcial es difícil de descartar, porque los atributos físicos de los hazaras y partes de su cultura e idioma se parecen a los de los mongoles. Por lo tanto, es ampliamente aceptado que los hazaras tienen ascendencia mongol, si no un descendiente directo de hombres de Genghis Khan, como alegan algunos hazaras. Algunas tribus hazaras llevan el nombre de los famosos generales mongoles, incluido el tulai Khan Hazara, que lleva el nombre de Tolui, el hijo más joven de Genghis Khan. Las teorías de ascendencia mongol o parcialmente mongol son plausibles, dado que los gobernantes mongoles de Il-Khanate, comenzando con Oljeitu, abrazaron el Islam chiíta. Hoy, casi todos los hazaras se adhieren al chiismo, mientras que los otros grupos étnicos de Afganistán son en su mayoría sunitas.
Otra teoría propone que los hazaras son descendientes de los Kushans, los antiguos habitantes de Afganistán famosos por construir los Budas de Bamiyan. Sus defensores encuentran sugerente la ubicación de la patria hazara y la similitud de los rasgos faciales de los hazaras con los de los frescos y las estatuas de Buda en Bamiyan. Sin embargo, esta creencia es contraria no solo al hecho de que los Kushans eran tocharios indoeuropeos, sino también a registros históricos que mencionan que en una batalla particularmente sangrienta alrededor de Bamiyan, el nieto de Genghis Khan, Mutugen, fue asesinado, y ordenó a Bamiyan que ser quemado en el suelo en retribución, renombrándolo Ma-Obaliq (“Morada inhabitable”) mientras reemplaza a la población local con sus ejércitos y colonos [cita requerida].
Una tercera teoría, y la aceptada por la mayoría de los estudiosos, sostiene que los hazaras son una raza muy mixta. Esto no es totalmente inconsistente con el descenso de las fuerzas militares mongolas. Por ejemplo, los mongoles Nikudari se establecieron en el este de Persia y se mezclaron con poblaciones nativas que hablaban varios idiomas iraníes. Una segunda ola de mongoles en su mayoría chagatai provino de Asia Central y fue seguida por otros turco-mongoles, asociados con el ilkhanate (expulsado de Persia) y los timúridos, todos los cuales se establecieron en Hazarajat y se mezclaron con la población persa local, formando una grupo distinto
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