La posición de la Santa Sede fue extremadamente difícil. La Iglesia trató de tomar el terreno moral en muchos temas, como salarios justos, bienestar social, libertad personal, crimen organizado, etc. Al mismo tiempo, tuvieron que lidiar con un régimen fascista en Italia que, sin duda, resolvió mucho de problemas una vez que se firmó el Tratado de Letrán.
En este momento, en la década de 1930, la Italia fascista estaba tomando medidas enérgicas contra el crimen organizado con el que la Iglesia estaba de acuerdo. Pero durante la década de 1930, la Iglesia también se opuso al régimen nazi radical en Alemania y, por supuesto, al régimen comunista en la Unión Soviética.
Durante la guerra, la Santa Sede tuvo que elegir el menor de varios males y, por un lado, abogaron por la cruzada alemana contra el ‘comunismo impío’ mientras que al mismo tiempo se aliaron en secreto con las potencias occidentales para derribar a la Alemania nazi ( que irónicamente incluía tener lazos cercanos con el crimen organizado en Italia). Una vez que se aseguró la victoria en Europa, los Aliados querían utilizar a los alemanes en su lucha contra el comunismo y la Iglesia amablemente lo obligó, ya que todavía consideraban que el comunismo era malo. Algunos alemanes fueron llevados directamente a los Estados Unidos y / o Gran Bretaña, mientras que otros “escaparon” con la ayuda de la Iglesia y varias organizaciones secretas aliadas. El problema es que había tantos que la Iglesia realmente no podía verificar a quién estaban ayudando a escapar (el caos gobernaba como supremo en Europa) y algunos líderes religiosos simpatizaban mucho más con los nazis que otros; simplemente no había una política central.
Los más siniestros como Eichmann fueron ayudados por los principales simpatizantes nazis dentro de la Iglesia y no son representativos de la política o la moral general de la Iglesia.