Físicamente hablando, se mató poco a poco, principalmente a través de incendios, lo que para un edificio lleno de pergaminos inflamables y mucha madera quizás no sea demasiado sorprendente. No estamos exactamente seguros de cuánto daño se hizo en un momento determinado, pero sí sabemos de ciertos incidentes donde hubo sin duda un daño importante.
El primero fue en el 48 a. C. durante la guerra civil romana de la época en que César fue asediado en Alexandra hasta que llegaron tropas amigas a rescatarlo. Como parte de los combates generales, partes de la ciudad fueron incendiadas y la conflagración finalmente llegó a la biblioteca. Puede haber sido totalmente destruido en ese momento o simplemente haber sufrido daños importantes, pero de cualquier manera, sin duda, se perdió material valioso de forma permanente. Sin embargo, al menos la biblioteca fue reconstruida, aunque nuevamente no estamos seguros de cómo la Biblioteca 2.0 se comparó con su encarnación anterior.
Eventos similares causaron más daños a la biblioteca en el año 270 d. C. y luego después del año 391 d. C., cuando el ahora Imperio Romano Cristiano declaró ilegales los sitios paganos. Con la biblioteca asociada y parcialmente alojada dentro de los edificios religiosos paganos, se cree que la biblioteca causó más daños, si no la destrucción total, gracias al fanatismo religioso de la época, aunque lo que quedaba del famoso lugar y su contenido para entonces es poco claro. El final final llegó en el 642 dC cuando los nuevos conquistadores musulmanes de Egipto se deshicieron de lo poco que quedaba de la biblioteca por razones sectarias similares.
Pero, en un sentido más amplio, la desaparición de la Biblioteca de Alejandría se produjo debido al creciente desinterés en las actividades intelectuales y científicas que surgieron lentamente después del período de la “iluminación” griega antigua en la segunda mitad del primer milenio antes de Cristo. el racionalismo dio paso a las creencias religiosas y la superstición, y la civilización occidental tardó muchos siglos en volver a ponerse al día.
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Pero, al menos, así lo atestigua nuestra sociedad tecnológicamente avanzada actual. Y, más concretamente, la Biblioteca ha renacido en una nueva encarnación moderna. Con suerte, alguna marea futura de intolerancia religiosa y antiintelectualismo no traerá algún día una segunda edad oscura.