La respuesta corta es sí. En el Japón medieval había dos grandes aldeas ninja que competían por el empleo de los clanes locales. Se llamaron Iga y Koga, y se utilizaron principalmente durante el siglo XVI. Los ninja, aunque muy geniales hoy, fueron vistos más como un mal necesario en aquel entonces por los daimyo (la gente rica). No fueron respetados, y simplemente se usaron como herramientas para el asesinato, la recopilación de información, etc. y debido a esta competencia, tratarían de demostrar que sus habilidades eran superiores y, a menudo, mostrarían sus habilidades de sigilo y conocimiento. Desarrollaron cosas como shuriken con punta de veneno, aparatos de respiración bajo el agua, excelentes técnicas de navegación y un camuflaje increíble. Esto se debía a que no les importaba lo que tenían que hacer para hacer el trabajo, siempre y cuando se hiciera. Todavía se preocupaban por el honor entre ellos y todo, pero no eran tan estrictos como los samurai.
De todos modos, sí, los ninjas disfrutaron de estos mitos porque significaba que los contrataban con más frecuencia.