Todos los que están fuera del África subsahariana tienen en promedio un 2,4% de neandertales y muchos también forman parte de Denisovan. La mayoría de los africanos al sur del Sahara no tienen neandertales o denisovanos. Esto incluye a los nativos americanos. También algunas líneas genéticas de los nativos americanos provienen de los mismos lugares cerca del lago Baikal que también se trasladaron al oeste hacia Europa cuando el hielo se derritió y se repobló (R y dna).
El niño Mal’ta del oeste del lago Baikal, de hace 24,000 años, es basal para muchos europeos, asiáticos centrales (especialmente los kets, nganasans y yukaghirs) y algunos nativos americanos del noreste. Los especímenes de Afontova Gora en el río Yeniséi de hace 17,000 años también formaron parte de estas personas. Las personas Yamnaya que entraron en Europa eran una mezcla que era 50% de este grupo.
Pero la mayoría de los nativos americanos están principalmente relacionados entre sí y comparten las líneas de ADN que surgieron en la llanura de Beringia y en el nuevo mundo. Se cree que las partes de este que se encuentran en el norte de Asia son la migración de regreso desde el área de Bering.
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Este está más relacionado con los asiáticos centrales como los kazajos.
En la línea de ADN mt materno, todo el ADNmt amerindio indígena se remonta a cinco haplogrupos, A, B, C, D y X. El 95% del ADNm amerindio indígena desciende de una población femenina fundadora genética mínima, que comprende sub-haplogrupos A2 , B2, C1b, C1c, C1d y D1. El 5% restante está compuesto por los sub-haplogrupos X2a, D2, D3, C4 y D4h3.
X no se encuentra tanto en el este de Asia. Se cree que vino con las mismas poblaciones fundadoras y el otro ADN mt de las áreas de las montañas de Altai.
A2a y A2b llegaron por última vez desde Siberia hace aproximadamente 1000–1500 años y se extendieron a través de las poblaciones inuit.