El nombre Kagoshima proviene del Santuario Kagoshima. Algunos dicen que se refiere a los dioses encerrados como si estuvieran en una isla. Otros dicen que se refiere a Sakurajima. Esta área de Japón se llamaba tradicionalmente Satsuma, y fue renombrada en 1868 como parte de la declaración de un nuevo estado japonés con poder centralizado en el gobierno de Tokio.
El nombre de Fukushima fue la elección personal de un samurai llamado Kimura Yoshikiyo, quien capturó el Castillo Suginome en 1592. Él lo llamó metafóricamente una “isla de la suerte” para él personalmente y lo renombró a Fukushima (isla de la suerte). Cuando el gobierno de Meiji consolidó las regiones de Aizu, Nakadōri y Hamadōri en 1868, nombraron a la nueva prefectura en honor al Castillo de Fukushima. El castillo fue demolido y reconstruido como el edificio de la capital de la prefectura de Fukushima, que aún se conserva hoy.